Фамилия Бакисов представляет собой вариант фамилии Багисов, которая произошла от имени Багис. Оно восходит к тюркскому слову «бага», которое переводится как «бог, божественный». Давая такое имя своему ребенку, родители как бы указывали на его связь с божественным началом. По другой версии, фамилия Бакисов произошла от прозвища Бакис. Имя Бакис в Древней Греции принадлежало составителю первого сборника прорицаний. Впоследствии его имя стало нарицательным для всех предсказателей. Вероятно, прозвище Бакис было дано человеку, который занимался предсказаниями. Таким образом, потомок человека, которого звали Багис (Бакис), со временем получил фамилию Бакисов.