Фамилия Баклинова — женская форма фамилии Баклинов, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем Баклан. Вопреки возможной ассоциации с птицей (баклан — морская водоплавающая птица), в основе фамилии чаще всего лежит не орнитологическое, а человеческое прозвище. В русских говорах слово «баклан» имело несколько значений: так могли называть большого, неуклюжего человека, а также болтливого или нахального. В некоторых диалектах «бакланить» означало «кричать, шуметь, бахвалиться». Таким образом, первый носитель фамилии — Баклан — получил прозвище за внешность или характер.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов (-ин) в мужской форме указывает на принадлежность — «сын Баклана» или «из семьи Баклана». Фамилия Баклинова, соответственно, означает «дочь или жена Баклинова». Суффикс -ин в данном случае присоединился к основе на твёрдый согласный (Баклан), что типично для русских фамилий северных и центральных регионов. Географически фамилия Баклинов встречается не слишком широко, но её следы есть в документах по Владимирской, Костромской и Ярославской губерниям — областях, где диалектное слово «баклан» было в ходу.

Интересная деталь: фамилия Баклинов могла возникнуть и от имени Баклан, которое в дохристианской Руси давали как оберег — чтобы отвести от ребёнка злые силы. В таком случае имя-прозвище не несло отрицательной оценки, а служило защитной функцией. Современные носители фамилии Баклинова, скорее всего, потомки крестьян или посадских людей, так как фамилии на -ов/-ин у дворянских родов встречаются реже и обычно имеют другую этимологию.