Фамилия Баковецька — украинская по происхождению, что выдаёт суффикс -цьк- (-цк-), типичный для фамилий, образованных от географических названий. В русской традиции этот суффикс превращается в -цк-, а в украинском сохраняет мягкость: Баковецька. Это женская форма; мужская — Баковецький.

Основа фамилии — топоним Баковець або Баковцы. Таких названий в Украине несколько: например, село Баковцы в Львовской области или Баковець в Ивано-Франковской. Первый носитель фамилии, скорее всего, получил её по месту жительства или происхождения: «из Баковець» — то есть человек, переселившийся из этого села или владевший там землёй. Модель образования «название села + -цький» была особенно распространена среди украинской шляхты и казацкой старшины в XVI–XVIII веках, но позже такие фамилии закрепились и у крестьян, записанных по месту рождения.

Корень «Бак-» в топониме может восходить к личному имени Бак (уменьшительное от Богдан, Бакун или даже тюркское «бак» — «смотри, взгляд») либо к диалектному слову «бак» — ёмкость для жидкости, чан. Второй вариант менее вероятен для названия села: обычно топонимы с таким корнем связывают с именем первопоселенца. Сравните с фамилиями Баковский, Баковец — они однокоренные и указывают на ту же географическую основу.

Фамилия Баковецька встречается преимущественно в западных областях Украины — Тернопольской, Львовской, Ивано-Франковской. За пределами Украины она редка, что подтверждает её локальное происхождение. В документах XIX века такую фамилию могли записать по-разному: Баковецкая (русифицированный вариант), Баковецька (украинское правописание) или даже Баковецкая с окончанием -ая, если речь о женщине в русскоязычной метрике.

Отдельного внимания заслуживает ударение. В украинском языке оно падает на второй слог: Бакове́цька. В русском произношении часто смещается на третий — Бакове́цкая, что стирает исходную фонетику. Для тех, кто ищет свои корни, это может быть подсказкой: если в семейных преданиях фамилию произносили с ударением на «е», скорее всего, предки были из тех самых западных сёл с названием Баковцы.