Фамилия Бакутис — редкий для России случай балтийского происхождения, и её разбор упирается в литовский или латышский языки. Чаще всего её связывают с латышским словом bakas — «оспа». Если эта версия верна, прозвище Бакутис мог получить человек, переболевший этой болезнью и носивший следы на лице, что было распространённой практикой именования в донаучную эпоху. Менее вероятная, но тоже возможная гипотеза отталкивается от литовского глагола bakstelėti — «ткнуть, боднуть, стукнуть». В таком случае прозвище могло закрепиться за вспыльчивым человеком, склонным к резким движениям или рукоприкладству.

Словообразовательная модель здесь не славянская, а балтийская. Суффикс -ис (в русской передаче -ис) — типичный литовский показатель мужского рода в фамилиях, соответствующий русскому -ов/-ин. В Литве фамилии с этим окончанием носят примерно 40% населения. В латышском языке тот же суффикс выглядит как -ис, но фамилии на -ис встречаются реже и часто имеют иную огласовку основы. Поскольку в написании Бакутис фигурирует именно -ис, а не, скажем, Бакутис с латышским окончанием, версия о литовском корне выглядит чуть стройнее, хотя обе гипотезы остаются в пределах балтийской ономастики.

Важно понимать, что ни одна из версий не даёт точного указания на социальный статус предка. Оспа не была болезнью какого-то одного сословия, а прозвище «тычок» могло возникнуть в любой среде. Географически фамилия Бакутис тяготеет к приграничным районам современной Литвы и Латвии, а также к тем регионам Российской империи, куда в XIX–XX веках переселялись балтийские крестьяне и мещане. Встречается она редко, поэтому её носителям стоит искать корни не в центральной России, а в западных губерниях — Ковенской, Виленской или Курляндской.