Фамилия Балаклейцев — одна из тех русских фамилий, чья география говорит сама за себя. В основе лежит топоним Балаклея — название нескольких населённых пунктов на юге России и Украины. Самый известный из них — город Балаклея в Харьковской области, основанный казаками. Именно с этой местностью, скорее всего, и связаны предки носителей фамилии.

Модель образования проста: к названию города или села (Балаклея) добавлялся суффикс принадлежности -ев, указывающий на выходца оттуда. Форма Балаклейцев — это уже патронимическая перестройка: сначала появилось отчество Балаклейцев («сын Балаклейца»), которое затем закрепилось как фамилия. Суффикс -ев здесь не случаен: он типичен для фамилий, образованных от основ на -я (сравните: Зверев, Андреев). Буква «ц» в середине — результат чередования в древнерусском: Балаклея → балаклеец → Балаклейцев.

Сам топоним Балаклея, по наиболее принятой версии, восходит к тюркскому «балакла» — «рыбное место» или «грязь, болото». В словаре В. И. Даля зафиксировано слово «балаклей» в значении «глухой лес, заваленный колодником». Но в контексте фамилии важнее другое: Балаклейцев — это не ремесленная и не прозвищная фамилия, а чисто географическая. Она отвечает на вопрос «откуда?», а не «кто по профессии?». Такие фамилии в России активно формировались в XVII–XVIII веках, когда крестьяне и казаки получали прозвания по месту прежнего жительства после переселения.

Сословная принадлежность у Балаклейцевых могла быть разной. Балаклея — исторически казачий регион, поэтому часть носителей фамилии, вероятно, происходила из казачьих родов Слобожанщины. Но встречались и крестьяне, и мещане — фамилия не элитарная и не редкая, но и не массовая. В современных телефонных справочниках и базах данных она встречается преимущественно в южных областях России (Ростовская, Волгоградская области, Краснодарский край) и на востоке Украины.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Балаклеев — более старая и простая форма (без суффикса -ц-). Балаклейцев же — вариант, где отчество образовано от прозвища «балаклеец» (житель Балаклеи), что встречается реже. В словаре Б. О. Унбегауна «Русские фамилии» подобные модели описаны как типичные для восточнославянской ономастики, но пример Балаклейцева там не приводится — фамилия довольно локальная.