Фамилия Баламеев — редкая и неоднозначная с точки зрения происхождения. Её основа, «Баламей», может восходить к нескольким источникам, и чтобы понять, какая версия правдоподобнее, стоит разобрать словообразовательную модель и географию.

Самая вероятная версия — прозвищная, от диалектного слова «балама» или «баламут». В южнорусских и украинских говорах «балама» — это путаник, бестолковый человек, а «баламутить» значит мутить воду, сбивать с толку. Суффикс «-ей» в прозвище «Баламей» — редкий, но известный в русской антропонимии (ср. Балахоней, Балагурей). Так могли назвать человека неспокойного, болтливого или склонного к ссорам. Фамилия образована по стандартной модели: прозвище на «-ей» плюс притяжательный суффикс «-ев» (чей? — Баламеев).

Вторая версия, менее убедительная, — от тюркского имени Баламей, где «бала» — дитя, «мей» — вино, но такое имя не фиксируется в известных ономастических словарях. Также не стоит путать с фамилией Баламеев, которая могла возникнуть от крестильного имени Варлаам (в просторечии Валамей) через замену «в» на «б» — но это гипотеза без надёжных подтверждений.

Фамилия крайне редкая. В дореволюционных источниках и современных базах данных она встречается точечно, преимущественно в южных регионах России (Курская, Воронежская области) и на Украине. Это указывает на прозвищное, а не на приходское или книжное происхождение: в тех краях «балама» было живым словом.

Таким образом, скорее всего, Баламеев — потомок человека, которого в деревне прозвали Баламеем за его характер или манеру речи. Фамилия сохранила редкий диалектный корень, который уже почти ушёл из языка.