Фамилия Балацын — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней нет привычного славянского суффикса -ов или -ин, что сразу наводит на мысль об иноязычной основе. Скорее всего, перед нами пример фамилии, образованной от прозвища или имени, записанного на слух русскими писцами.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию Балацын с румынским или молдавским словом «bălăcean» (бэлэчан) — «беловатый», «светловолосый», «белокурый». В Молдавии и на юго-западе Российской империи (Бессарабия, Подолье) такие прозвища были распространены. Суффикс -ын в русской передаче часто заменял румынское окончание -ан или -ян. Таким образом, Балацын — это «сын Балацана», то есть потомок человека по прозвищу Беляк или Светлый.

Менее вероятна, но возможна связь с тюркскими языками, где «бала» означает «дитя», «ребенок», а «цын» может быть искажённым окончанием. Однако в таком случае фамилия выглядела бы скорее как Балаев или Балалыкин. Версия с румынским корнем выглядит убедительнее ещё и потому, что фамилии на -ын (вроде Балацын, Гагаузын, Карацын) характерны именно для зоны контакта славянских и романских языков.

По сословной принадлежности предки Балацыных, скорее всего, были крестьянами или мещанами из юго-западных губерний. Фамилия не дворянская, не купеческая — она указывает на человека из простонародья, которого прозвали за цвет волос или кожи. Встречаемость фамилии сегодня крайне низкая, и это делает её ценной для генеалогии: каждый носитель Балацын, вероятно, происходит из очень узкого круга семей, живших на стыке украинской, молдавской и русской культур.