Фамилия Банис чаще всего восходит к уменьшительно-ласкательной форме имени Бенедикт — Банис. Это имя имеет латинские корни и переводится как «благословенный». Широкое распространение в Европе имя получило в Средние века благодаря Святому Бенедикту Нурсийскому, основателю Бенедиктинского ордена в Монте-Кассино и автору знаменитого свода монашеских правил.

Словообразовательная модель здесь незамысловата: латвийское уменьшительное имя Банис стало прозвищем, а затем и фамилией. Такая модель типична для прибалтийского региона, где фамилии нередко образовывались напрямую от народных, обиходных вариантов крестильных имён, без дополнительных суффиксов.

Интересно, что фамилия Банис — одна из тех, что не получила в русском языке типичных окончаний (-ов, -ин), а закрепилась в «чистом» виде, как и многие другие фамилии латышского и литовского происхождения. Это указывает на то, что её носители, скорее всего, были выходцами из среды, где фамилии оформлялись по балтийской, а не по восточнославянской модели.

Вероятнее всего, предок человека с фамилией Банис был назван в честь святого Бенедикта, что говорит о христианских корнях семьи, возможно, связанных с католической традицией. Других версий происхождения, заслуживающих серьёзного рассмотрения, у этой фамилии нет — корень прозрачен, а альтернативные толкования были бы натянутыми.