Фамилия Баракаускас — литовского происхождения, и её разумнее анализировать не по русской, а по литовской словообразовательной модели. Типичный литовский суффикс -auskas (в русской передаче — -аускас) указывает на принадлежность к роду или местности. В основе лежит имя или прозвище Баракас (Brakas). Само слово barakas в литовском языке означает «барак», «времянка» или «строение из досок». Однако напрямую выводить фамилию из этого слова стоит с осторожностью: прозвище могли дать человеку, жившему в таком строении, строившему их или просто имевшему с ними бытовую связь.

Более вероятная версия — происхождение от антропонима Barakas, который мог быть вариантом крестильного имени Варфоломей (лит. Baltramiejus) или уменьшительной формой от имени Баранаускас (Baranauskas), где baronas — «барон», но с утратой слога. В пользу этого говорит и география: фамилия Баракаускас встречается в основном в Литве и среди литовской диаспоры, а также в пограничных с Литвой районах Беларуси и Польши, где в XIX веке активно шла литуанизация фамилий.

Интересная деталь: в русских документах XIX века, особенно в Ковенской и Виленской губерниях, фамилию часто писали как «Бараковский» — это типичная русификация окончания. Литовский суффикс -auskas в имперской канцелярии заменяли на русский -овский, что создаёт видимость польского происхождения. На самом деле Баракаускас — чисто литовская фамилия, и её носители, скорее всего, были крестьянами или мелкими землевладельцами, а не шляхтой, так как окончание -auskas в Литве характерно именно для простонародья.