Фамилия Барболина образована от мирского имени или прозвища Барболя. В основе этой фамилии лежит украинское диалектное слово «барболя» или «бараболя» — так в некоторых регионах Украины называют картошку. Такая основа необычна для русских фамилий: чаще всего фамилии образуются от имён, профессий или черт характера, а здесь — от названия огородного растения.

Скорее всего, Барболя — это охранительное мирское имя. Давая ребёнку имя по названию растения, родители верили, что природа примет его как своего и передаст ему свои качества. Картофель — сытный, живучий корнеплод, поэтому имя должно было пожелать ребёнку здоровья, выносливости и благополучия.

Возможна и другая версия: прозвище Барбола могло указывать на род занятий предка — например, на выращивание картофеля или торговлю им. Или же на внешность: человека могли прозвать Барболой за круглую фигуру или приземистость, то есть за сходство с клубнем.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «Барболина» означает «дочь или жена Барболи» (в женском роде), а в мужском варианте — «сын Барболи». Такая модель типична для фамилий, возникших от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а или -я.

Фамилия редкая и имеет ярко выраженную региональную привязку к южнорусским и украинским говорам. Встречается преимущественно в форме Барболин (мужской вариант) и Барболина (женский). Сравните с однокоренными фамилиями Бараболя, Бараболин, Бараболина — они образованы от того же корня с чередованием гласных.