Фамилия Бардаченко образована по распространённой в украинской и белорусской традиции модели: к основе прибавлялся суффикс -енко, который изначально означал «сын» или «потомок». Таким образом, Бардаченко — это буквально «сын Бардача» или «потомок Бардача». Сама основа, прозвище Бардач, восходит к нарицательному «барда» — слову с несколькими значениями, и это даёт ключ к пониманию того, кем мог быть предок.

В корне лежит «барда» — гуща, остатки от перегонки хлебного вина (браги), которые шли на корм скоту. В других говорах так называли мутный отстой при перетопке сала, а также плохую, бесплодную, болотную или каменистую почву. Казалось бы, значения не самые лестные, и прозвище Бардач могло относиться к человеку, имевшему дело с такой «бардой»: например, к винокуренному мастеру, мяснику или плотнику. Однако в ономастике редко бывает одна прямая линия.

Интереснее версия, которую поддерживают некоторые исследователи: «барда» в переносном смысле — это «беспорядок, сумбур», а Бардач — человек, который «бардычит», то есть делает что-то небрежно, путает. Но в народной этимологии есть и другой поворот. Слово «барда» созвучно «барду» — поэту-певцу в кельтской традиции. Хотя прямого заимствования из кельтских языков в русские говоры не было, в XIX веке слово «бард» вошло в русский язык через литературу. Исходя из этого, можно предположить, что в сознании носителей фамилии прозвище Бардач иногда переосмыслялось как связанное с сочинением и исполнением песен.

Наиболее правдоподобная версия всё же бытовая: Бардач — это человек, который работал с бардой, то есть либо занимался винокурением, либо держал скот на откорме такой гущей. Фамилия Бардаченко, как и многие фамилии на -енко, закрепилась на южных землях — в современной Украине и прилегающих областях России. Позже прозвище Бардач, изначально присоединённое к наследственному имени, полностью заменило его как в повседневной жизни, так и в официальных документах, дав начало фамилии, которую мы знаем сегодня.