Фамилия Байдаченко — пример украинской модели образования фамилий с суффиксом -енко, который указывает на происхождение по отцу («сын Байдача»). В центре внимания — прозвище Байдач, от которого и пошла фамилия.

Самая распространённая версия связывает основу с нарицательным «байда». У этого слова в русских и украинских говорах несколько значений: так называли промысловое судно (лодку или барку), а также беззаботного, гулящего человека, повесу. В некоторых диалектах «байда» — это ещё и кусок чего-то хрупкого (хлеба, сахара, дерева). Какое из значений легло в основу прозвища, сказать сложно, но скорее всего — характер или род занятий: либо лодочник, рыбак, либо человек с вольным нравом.

Есть и вторая, менее очевидная гипотеза — топонимическая. В Пермской области существует село Байдач на одноимённой речке. Однако фамилия Байдаченко с суффиксом -енко типична для украинской ономастики, а не для пермских земель, где преобладают фамилии на -ов и -ин. Поэтому версия с географическим названием выглядит менее правдоподобной: скорее всего, село названо по фамилии первопоселенцев или прозвищу, а не наоборот.

Словообразовательная модель Байдаченко — от прозвища Байдач через прибавление патронимического суффикса -енко. Такие фамилии массово формировались в центральных и левобережных регионах Украины в XVI–XVII веках. Сравните с однокоренными: Байда, Байдак, Байдаченко — все они восходят к одному корню, но различаются суффиксами, которые указывали на степень родства или ветвь рода.

Таким образом, носитель фамилии Байдаченко — потомок человека по имени или прозвищу Байдач, чьё имя могло быть связано либо с ремеслом (судовождение), либо с особенностями характера (беспечность, удаль).