Фамилия Бардунаев образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Скорее всего, прозвище Бардунай восходит к нарицательному «барда», которое имеет несколько значений: «остатки от перегона хлебного вина из браги», «мутное, дурное питье», «плохая почва, бесплодная, болотная или каменистая». Таким образом, прозвище могло относиться и к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность человека (варка брагу). Возможно, что это прозвище могло носить иронический характер и даваться с целью подчеркнуть недостатки или дурные привычки человека (страсть к хмельным напиткам). Наконец, не исключено, что прозвище Бардунай мог носить крестьянин, который имел участок земли на месте с неплодородной почвой. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бардунай, со временем получил фамилию Бардунаев. О точном месте и времени возникновения фамилии Бардунаев в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Бардунаев представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.