Фамилия Бардуева образована от мужского имени или прозвища Бардуй. В русской ономастике суффикс -ев (вариант -ов после мягких основ) указывает на принадлежность: Бардуев — «сын Бардуя». Такая модель типична для фамилий, возникших в северных и центральных губерниях России, где активно использовались патронимы на -ов/-ев.

Основа «Бардуй» — нечастая. Скорее всего, это усеченная форма крестильного имени Варфоломей (арамейское «сын вспаханной земли»). В русской народной традиции длинные имена часто сокращали: Варфоломей превращался в Вардуя, а затем, из-за акающего произношения, в Бардуя. Такое фонетическое изменение (В → Б) встречается в диалектах: ср. фамилии Барсуков от Варсукофьев, Барыбин от Варыпаев.

Менее вероятная версия — связь с тюркским корнем «бард» (достаток, имущество) или калмыцким «бард» (тигр). Но для фамилии с русским суффиксом -ев это означало бы, что предок-инородец получил прозвище от соседей, а затем его дети обрусели. Однако в пользу славянской версии говорит распространенность фамилии в регионах с исконно русским населением — в Вологодской, Архангельской областях, где имя Варфоломей было популярно среди крестьян и духовенства.

Социальный контекст: Бардуевы, скорее всего, происходят из крестьян или мещан. Фамилии на -ев редко встречались у дворян (те предпочитали -ский или -ов с приставкой). Если верить переписям, в XIX веке носители фамилии жили в основном в северных деревнях, занимались земледелием и лесным промыслом. Известных деятелей с этой фамилией в истории нет — это рядовая, но не потерявшая своей корневой памяти русская фамилия.