Фамилия Байдуева — женская форма от Байдуев, и её корни уходят в тюркскую языковую среду. Основа «Байду» почти наверняка восходит к тюркскому имени Байду, где «бай» означает «богатый», «господин», «хозяин», а «ду» — суффикс, образующий имя. В тюркской ономастике такие имена давали с пожеланием достатка и высокого положения. Встречается вариант Байдулла, где вторая часть — арабское «Аллах», но фамилия Байдуева образована именно от краткой формы Байду, что типично для народов Северного Кавказа, особенно осетин, ингушей и чеченцев.

Модель образования проста: к основе добавили русский патронимический суффикс -ев, который в XIX–XX веках массово прикрепляли к горским фамилиям при оформлении документов. Изначально Байдуев означало «сын Байду», а со временем закрепилось как родовая фамилия. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Байду́ева, хотя в разговорной речи возможны колебания.

Географически фамилия распространена в республиках Северного Кавказа, особенно в Ингушетии и Чечне, реже встречается у осетин и балкарцев. В дореволюционных метрических книгах и списках переселенцев её фиксировали как Байдуев, Байдуов — написание менялось из-за разницы в произношении гласных в разных диалектах. Сословно предки Байдуевых чаще всего были свободными горцами-общинниками, реже — узденями (дворянами) у балкарцев или кабардинцев, но единого аристократического статуса у фамилии нет.

В русском контексте фамилия остаётся редкой, и её носители — в основном потомки выходцев с Кавказа. Разбирать её по славянским корням бессмысленно: это чистый тюркизм, адаптированный русской грамматикой. Спорных версий происхождения практически нет — все ономасты сходятся на имени Байду, что делает историю фамилии прозрачной и однозначной.