Фамилия Барнаковский — одна из тех, где на первый взгляд всё ясно, но при ближайшем рассмотрении открывается несколько версий. Её основа — «Барнак» — может восходить как к имени собственному, так и к названию места. Судя по суффиксу «-ский», это типичная «географическая» фамилия польского или западнорусского образца. Её давали не просто по отцу, а по владению землёй или по месту жительства: Барнаковский — значит «тот, кто из Барнакова» или «из Барнаковичей».

Первый и самый очевидный путь — связать основу с городом Барнаул. Однако это ошибка: фамилия Барнаковский не имеет прямого отношения к сибирскому городу. Барнаул получил название от тюркского «борун» (нос, мыс) и «ул» (река), а «Барнак» — совсем другая история. Скорее всего, это прозвище или имя тюркского происхождения, где «бар» — «есть, имеется», а «нак» — уменьшительный суффикс. В таком случае Барнак могло означать «маленький богач» или «тот, у кого что-то есть». В русских диалектах слово «барнак» не зафиксировано, зато в татарских и башкирских именах корень «бар» встречается часто.

Вторая версия — топонимическая. На карте России и Беларуси есть несколько мелких хуторов и урочищ с названием Барнаки или Барнаково. Исследователь русских фамилий Б. Унбегаун отмечал, что фамилии на «-ский» в XVII–XVIII веках часто получали дворяне и шляхта по названию родового имения. Если предки Барнаковских владели землёй в местечке Барнаки (например, на территории современной Смоленской или Могилёвской области), то фамилия закрепилась именно как указание на родовое гнездо.

Третья, менее вероятная, но возможная версия — отчество от крестильного имени Варнава. В просторечии Варнаву могли называть Барнавой (с заменой «в» на «б»), а от уменьшительной формы Барнак и пошла фамилия. Однако суффикс «-овский» в этом случае выглядел бы как Барнавовский, а не Барнаковский. Поэтому эта гипотеза слабая.

В написании фамилии есть особенность: ударение, скорее всего, падает на третий слог — Барнако́вский. Это типично для фамилий с суффиксом «-овский», образованных от основ, оканчивающихся на согласный. Встречается и вариант Барнаковско́й, но он редок и свойственен южнорусским говорам.

Сословно фамилия неоднородна. В польских метриках XVIII века попадаются Барнаковские среди мелкой шляхты, а в российских ревизских сказках XIX века — среди однодворцев и крестьян. Это значит, что фамилия не закреплялась строго за одним сословием: её могли носить и обедневшие дворяне, и вольные хлебопашцы, перешедшие на новое место и записанные по названию прежнего села.

Если коротко: Барнаковский — фамилия с тюркским или топонимическим корнем, оформленная по польско-русской модели. Её носители, скорее всего, происходят из западных или южных регионов России, где смешивались славянские и тюркские традиции именования.