Фамилия Башагуров — редкий образец, где корень почти наверняка тюркский, а оформление — русское, с типичным суффиксом принадлежности -ов. Основа «Башагур» не имеет прямого значения в русском языке, поэтому искать её происхождение нужно в языках народов Поволжья, Кавказа или Средней Азии.

Самый вероятный источник — тюркское слово «баш» (голова, главный) в сочетании с «агур» или «агул» (тяжёлый, грузный, либо — в некоторых диалектах — «гур» как обозначение могилы или кургана). Таким образом, исходное прозвище Башагур могло означать «тяжелая голова» — либо в прямом смысле (физическая особенность), либо переносно: упрямый, важный, медлительный человек. Возможна и более прозаическая версия: «баш-агур» как «главный над тяжёлой работой» — например, старший грузчик или надсмотрщик.

Менее вероятна, но не исключена связь с арабским «башар» (человек, человечество) через диалектную перестройку. Однако для фамилий, бытовавших в крестьянской среде, конкретное прозвище по признаку весомее абстрактного понятия.

Фамилия не встречается в списках дворянских родов и не фиксируется в старых боярских книгах. Это поздняя, «бытовая» фамилия, которая могла оформиться в XIX веке у татар, башкир или представителей других тюркских народов, перешедших на русскую модель именования. Географически она тяготеет к Оренбуржью и Башкортостану — регионам, где русский суффикс -ов накладывался на местные прозвища.

Словообразовательно фамилия стоит особняком: в ней нет уменьшительных суффиксов (-к-, -ик-), нет отчества на -ич. Это прямая русификация цельного тюркского прозвища. Такие фамилии — свидетельство культурного пограничья, где человек сохранял родовое имя, но оформлял его по государственному стандарту Российской империи.