Фамилия Башкановы (в мужском варианте Башканов) не укладывается в одну простую схему. Скорее всего, перед нами два омонимичных рода с разными корнями, и географическая привязка помогает понять, о какой именно ветви идет речь.

Первый и наиболее вероятный источник для носителей из Поволжья — финно-угорский, а именно эрзянский. Прозвище Башкан образовали от эрзянского слова «башка» — «отдельный, единичный» или «башкань» — «особенный». Так могли назвать человека, который жил обособленно, на выселке или на краю села. Это объясняет, почему фамилия встречается в Сызрани и других местах традиционного расселения мордвы (мокши и эрзи).

Вторая версия связывает фамилию с тюркским или молдавским влиянием. В турецком языке есть слово başkan — «глава, председатель». В современной Гагаузии (автономия на юге Молдавии) башканом называют высшее должностное лицо. Если предки носили фамилию Башканов и жили на Украине или в Молдавии, прозвище могло указывать на высокое положение — главу селения или совета. В этом случае фамилия представляет собой русифицированный вариант молдавской или гагаузской фамилии.

Разные основы дали две фамилии, которые сегодня звучат одинаково. Различить их можно только по региону: поволжские Башкановы, скорее всего, ведут род от мордовского родоначальника, а украинские — от гагауза или молдаванина. Точное время возникновения каждой из ветвей устанавливается только через генеалогические разыскания.