Фамилия Башкетова — редкий пример, где тюркская основа не затерялась в веках, а сохранила прозрачную внутреннюю форму. Её ядро — составное прозвище Башкет, которое складывается из двух тюркских корней: «баш» (голова, глава, верховный) и «кет» (человек, личность). Буквально Башкет — «главный человек», «первый среди людей». Слово «кет» в этом значении восходит к древнетюркскому «кеш» или «кет» и встречается в ономастике реже, чем «баш», что делает фамилию особенно интересной для этимолога.

Такое прозвище вряд ли давали простому крестьянину. Скорее всего, его носитель принадлежал к привилегированному сословию — мог быть старшиной, военным предводителем, сборщиком податей или главой рода. В тюркской среде прозвища с компонентом «баш» нередко закреплялись за людьми, которые реально «стояли во главе»: достаточно вспомнить фамилии Башлыков, Башаев, Башмаков (от «башмак» — тоже «глава» в переносном смысле). Башкетов — та же модель, но с более редким вторым элементом.

Фамилия бытует в формах Башкетов и Башкетова. Суффикс -ов указывает на русскую модель образования: так оформляли фамилии от тюркских прозвищ в XVI–XVII веках, когда татарская, башкирская и ногайская знать переходила на службу к московским князьям и получала земельные пожалования. Не исключено, что предки Башкетовых были выходцами из Казанского или Астраханского ханства, а позже вошли в состав служилых людей — например, толмачей или казаков.

Встречаемость фамилии невысока, что говорит о её локальном происхождении. Основные очаги — Поволжье (Татарстан, Башкортостан, Самарская область) и Урал. В документах XVIII–XIX веков Башкетовы фигурируют среди государственных крестьян и мещан, но корень прозвища намекает, что изначально статус был выше — просто за триста лет социальная лестница могла измениться.