Фамилия Бататын — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять её корень, стоит отбросить современное ассоциативное значение «батат» (сладкий картофель) — это слово пришло в русский язык через европейские языки из индейских языков таино лишь в XIX–XX веках, а фамилия явно старше.

Скорее всего, основа «Батат» — это диалектное или искажённое прозвище. В русских говорах слово «батать» означало «болтать, качать, бить», а «батат» могло относиться к человеку неуклюжему, болтливому или, наоборот, к тому, кто «батает» (работает веслом, бьёт масло, месит глину). В ономастике встречаются фамилии от глагольных форм, оканчивающихся на -ын: они указывают на принадлежность к роду человека с таким прозвищем. Суффикс -ын типичен для русских фамилий, образованных от основ на -а, -я (ср. Птицын, Лисицын). То есть Бататын — буквально «сын Батата» или «из семьи Батата».

Менее вероятная, но возможная версия — связь с тюркским корнем «бата» (сильный, крепкий) или «батыр» (богатырь), но форма «Бататын» нехарактерна для тюркских языков, где обычно встречаются Батаев, Батаров. Скорее всего, перед нами севернорусская или сибирская фамилия, где прозвища с окончанием -а были распространены, а суффикс -ын сохранился лучше, чем в центральных областях.

Географию фамилии установить сложно: в открытых источниках она встречается единично. Возможно, предок носителя был мастером по сбиванию масла (батать масло) или работал на речном транспорте (батать — грести веслом). В любом случае, фамилия Бататын — живой пример того, как редкое диалектное слово или прозвище закрепилось в родовом имени.