Фамилия Байдраковы восходит к тюркскому имени Байдарак. В основе, скорее всего, лежит составное имя: «бай» — «господин, богатый», словообразующий суффикс «-дар-» и «ак» — «белый». У тюркских народов белый цвет с древности символизировал чистоту, свет, справедливость и преданность. Таким образом, Байдарак — это человек, наделённый лучшими качествами.

Есть и другая версия: имя могло произойти от тюркского «байтерек» — «богатый тополь» или «древо мира». Со временем гласный «а» утратился, и фамилия закрепилась в современном звучании — Байдраков.

Исторически такие фамилии относятся к пласту древнейших восточных имён, которые вошли в русский обиход через выходцев из Золотой Орды, печенегов или половцев. Корни фамилии уходят в XV–XVII века. Проникновению тюркских основ в русские фамилии способствовал и тот факт, что немало дворянских родов в России имели нерусское происхождение. Фамилия Байдраковы — один из памятников этого культурного и языкового взаимодействия.