Фамилия Байгабул — редкий случай, когда исходное имя или прозвище почти не изменилось при переходе в фамилию. В ней нет типичных русских фамильных суффиксов (-ов, -ев, -ин), которые обычно прибавляют к основе: Байгабулов, Байгабулин. Сама форма Байгабул указывает на то, что это либо тюркское родовое имя, либо фамилия, застывшая в начальном виде без русификации. Чаще всего такие фамилии встречаются у татар, башкир, казахов и других народов, где отчество или прозвище могли стать фамилией без дополнительных формантов.

Основа фамилии составная. Первая часть — «Бай» — в тюркских языках означает «богатый», «господин», «хозяин». Вторая часть — «габул» — скорее всего, восходит к арабскому «кабул» (قبول), что значит «принятие», «согласие», «одобрение». В мусульманской традиции это слово связано с понятием принятия молитвы или благословения. Таким образом, имя Байгабул можно перевести как «богатый принятием», «щедро одарённый» или «господин, чья молитва принята».

Вероятнее всего, фамилия происходит от личного имени Байгабул, которое давали ребёнку с пожеланием, чтобы он был принят Богом, был удачливым и состоятельным. В прошлом такие имена-пожелания были распространены среди тюрко-мусульманских народов. Фамилия могла закрепиться за потомками человека, которого звали Байгабул, без добавления суффикса — это характерно для некоторых регионов Поволжья и Урала, где фамилии на -ов не всегда вытесняли исходную форму.

С точки зрения словообразования, фамилия интересна тем, что сохранила архаичную структуру составного имени. В отличие от более поздних фамилий, образованных от профессий или прозвищ по внешности, Байгабул несёт в себе религиозно-пожелательный смысл. Учитывая редкость фамилии и её прозрачную тюркскую этимологию, можно с уверенностью сказать, что её носители — потомки людей, живших в среде, где арабская лексика через ислам смешивалась с тюркской основой.