Фамилия Байкарова — женская форма фамилии Байкаров, и её происхождение напрямую связано с мужским именем или прозвищем Байкар. Слово это составное, тюркского происхождения, и его разбор даёт ключ к пониманию социального статуса или занятия предка.

Основа «бай» в тюркских языках означает «богатый, господин, хозяин». Вторая часть — «кар» — может восходить к разным корням. Самая вероятная версия: «кар» — это «снег» (в тюркских языках, например, в казахском, татарском, башкирском). Тогда Байкар — буквально «богатый снегом». Такое прозвище могли дать человеку, жившему в снежном краю, или, что более правдоподобно, скотоводу, чьё богатство (скот) благополучно переживало снежные зимы — снег обеспечивал влагой пастбища.

Есть и другая, менее распространённая трактовка: «кар» как «дело, работа» (ср. тюркское «кар» — дело, занятие). Тогда Байкар — «богатый делами», то есть человек, у которого много дел, хозяин, управляющий. В любом случае, прозвище Байкар указывало на состоятельность или влиятельность.

Суффикс «-ов» в фамилии Байкаров — типичный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность («чей?» — Байкаров сын). Таким образом, фамилия закрепилась в русской среде, скорее всего, среди обрусевших тюркских народов или в регионах, где тюркские и славянские фамильные модели смешивались: в Поволжье, на Урале, в Сибири. Носители фамилии Байкарова — потомки человека, которого в своё время прозвали Байкаром, и это прозвище говорило о его достатке или хозяйском положении.