Фамилия Бедункова — женская форма от Бедунков, а та, в свою очередь, образована от прозвища или нецерковного имени Бедун. Разбор этой фамилии интересен тем, что её основа неочевидна: она не связана напрямую с глаголом «бедовать» (жить в бедности), хотя такое созвучие напрашивается.

Скорее всего, в основе лежит диалектное слово «беда» в значении «бедовый, озорной, проказливый человек». В русских говорах «бедуном» или «бедовым» называли не того, кто страдает от несчастий, а того, кто сам создаёт хлопоты — непоседу, задиру, человека с крутым нравом. Суффикс -ун- в прозвище Бедун типичен для имён, характеризующих человека по действию или свойству (ср. «крикун», «молчун», «бегун»). Таким образом, Бедун — это не «бедняк», а «бедовый парень».

Менее вероятная, но возможная версия — связь с тюркским корнем «бед» (беда, несчастье) или с арабским «бад» (плохой). Однако для фамилий центральной России, где встречается Бедунков, такая этимология маловероятна. Скорее всего, фамилия исконно славянская, с характерным суффиксом принадлежности -ов-/-к-: Бедун → Бедунков (чей? — сын Бедуна).

Географически фамилия редкая и локальная. Основной ареал — южные области России (Воронежская, Ростовская), а также Украина. Встречается она и в Беларуси, но в меньшем количестве. Встречаются варианты написания «Бедуньков» и «Бедунко» (украинизированная форма). Сословно носители фамилии, судя по архивным данным, относились к крестьянам и однодворцам, что подтверждает бытовое, а не книжное происхождение основы.

Интересная деталь: фамилия Бедунков не фиксируется в дореволюционных дворянских родословных книгах, что указывает на её простонародное происхождение. В отличие от фамилий на -ский, которые часто давали семинаристам или дворянам, Бедунков — типичная «уличная» фамилия, закрепившаяся за одной семьёй по прозвищу её основателя.