Фамилия Бедюхов — один из тех случаев, когда написание подсказывает верное произношение, но скрывает истинное происхождение. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Бедю́хов. На слух основа кажется загадочной, но на деле она прозрачна.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), а основа — Бедюх. Это, в свою очередь, вариант прозвища или неканонического имени Бедюк, Бедя или Бедюха. В русских говорах «бедой» или «бедюгой» могли называть человека, приносящего несчастье, неудачника, или же, наоборот, — того, кто постоянно жалуется на бедность и судьбу. Прозвище давалось не в обиду, а как оберег: считалось, что если назвать ребенка Бедой, то злые силы к нему не притронутся. В ономастике этот приём называется «охранительным» или «отрицательным» именованием.

Есть и более конкретная версия. В некоторых южнорусских и украинских говорах «бедюх» означало «бедняк», «нищий». Однако фамилия Бедюхов — не крестьянская по суффиксу: окончание -ов характерно для центральной России и севера, а не для юга. Поэтому более вероятно, что исходное прозвище Бедюха (или Бедюх) бытовало в рязанских, владимирских или нижегородских землях, где суффикс -юх- был распространён (сравните: Ветрюх, Горюха, Худюха). Прозвище могло закрепиться за человеком, который пережил разорение, пал жертвой пожара или неурожая — и получил у соседей меткое прозвище, ставшее затем фамилией.

Интересно, что фамилия Бедюхов встречается редко и не имеет широко известных однокоренных вариантов вроде Беднов или Бедняков, которые образованы от той же основы, но с другими суффиксами. Это говорит о локальном бытовании прозвища: оно не стало общерусским, а закрепилось в одном-двух родах. В дореволюционных источниках Бедюховы фиксируются в основном среди государственных крестьян и мещан — то есть сословий, где прозвища передавались по наследству, но ещё не были окончательно закреплены в документах. Таким образом, носитель фамилии Бедюхов может считать своим предком человека, которого в деревне называли то ли шутливо-горемычным, то ли нарочито «несчастливым» для отвода глаз.