Фамилия Бекташян — армянская по форме, но в её основе лежит тюркское имя или прозвище. Суффикс -ян (в старой орфографии -янц) — один из самых распространённых армянских патронимических суффиксов, означающий «принадлежащий к роду» или «потомок». Таким образом, Бекташян — это потомок человека по имени или прозвищу Бекташ.

Само имя Бекташ — древнетюркское, сложенное из двух корней. Первый корень, «бек», означает «князь, повелитель, господин». Второй, «таш», переводится как «камень». Соединяясь, они дают значение «крепкий камень» или «твёрдый, как кремень». Это имя было обрядовым: его давали мальчику с пожеланием вырасти сильным и несгибаемым мужчиной. То есть фамилия Бекташян изначально несла пожелание родовой твёрдости и силы.

Существует и вторая версия, связывающая фамилию не с личным именем, а с прозвищем Бекташи. Так называли членов суфийского ордена Бекташи, основанного в XIII веке Хаджи Бекташем. В народной памяти бекташи остались как вольнодумцы, жившие вне строгих норм традиционного ислама. Поэтому прозвище Бекташи мог получить человек, который не слишком строго следовал религиозным канонам или держался свободных взглядов.

Какая из версий правдоподобнее? Имя Бекташ как личное имя встречается у тюркских народов, и армянские фамилии на -ян нередко образовывались от тюркских имён — это результат многовекового соседства и культурного обмена. Версия с суфийским орденом менее вероятна для массового бытования фамилии, но полностью исключать её нельзя: прозвище могло закрепиться за конкретным родом. В любом случае, обе версии ведут к одному смысловому корню — «крепкий, твёрдый» или «вольный, независимый».