Фамилия Бектыбаев образована от тюркского личного имени Бектыбай. Её основа составная, что типично для многих казахских и татарских фамилий. Первая часть — «бекты» — в казахском, татарском и киргизском языках означает «опора». Вторая часть — «бай» — переводится как «богатый хозяин», «могущественный человек», «господин». Соединившись, эти слова дали имя Бектыбай, которое родители могли дать сыну с пожеланием стать храбрым и добропорядочным мужчиной, надёжной опорой и защитником семьи и народа, потомком знатного бая.

Фамилия Бектыбаев — одна из тех, что образованы по русской модели прибавлением суффикса -ев к основе имени. В тюркских языках суффикс -ев/-ов не используется, поэтому сам факт такого оформления указывает на то, что фамилия возникла в среде, где уже действовали русские административные нормы — скорее всего, в XIX–XX веках при переписях населения. По этой причине фамилия встречается не только в Казахстане, но и в Башкортостане, Татарстане и среди ногайцев.

Интересно, что имя Бектыбай не зафиксировано в древних родословных как широко распространённое. Скорее всего, оно было локальным, родовым прозвищем или именем, данным по личному качеству. В отличие от имён с корнем «бек» (например, Бекболат или Бекмурат), где «бек» — это титул знати, здесь «бекты» несёт более бытовой смысл: не «князь», а именно «опора, поддержка». Это делает фамилию Бектыбаев близкой по смыслу к русским фамилиям вроде Опора или Крепыш, но с восточным колоритом.

В современном Казахстане Бектыбаевы живут в основном в Западном и Центральном регионах. Встречаются также в Астраханской области России и среди каракалпаков. Варианты написания — Бектебаев, Бектыбай — встречаются реже и, скорее всего, являются результатом ошибок при записи или диалектных различий в произношении.