Фамилия Белобородкина — женская форма фамилии Белобородкин, которая образована от прозвища или нецерковного имени Белобородка. В основе лежит сочетание «белая борода». В русской традиции белая борода — признак либо глубокой старости, либо седины от рождения, либо, реже, принадлежности к духовному сословию, где старцы с белыми бородами были образом мудрости. Прозвище Белобородка могли дать человеку, который рано поседел, или, напротив, старцу, чья борода выделялась цветом.

Словообразовательная модель здесь двойная. Сначала от прилагательного «белый» и существительного «борода» образовали сложное прозвище Белобородка. Затем к нему добавили патронимический суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: Белобородкин буквально означает «сын Белобородки». Суффикс -ин характерен для фамилий, образованных от слов женского рода на -а/-я, поэтому Белобородкин, а не Белобородов. Это отличает её от более распространённой фамилии Белобородов, где использован суффикс -ов (от «белая борода» без уменьшительного суффикса).

Фамилия Белобородкин встречается реже, чем Белобородов, и имеет более выраженную севернорусскую окраску. В документах XVII–XVIII веков прозвища с корнем «белобород-» фиксируются в Поморье и на Вятке, что подтверждают работы историка С. Веселовского. Вероятно, предки носителей фамилии Белобородкина были крестьянами или посадскими людьми из этих регионов. Дворянских родов с такой фамилией не отмечено — она оставалась в простонародной среде.

Однокоренные фамилии — Белобородов, Белобородько (украинская форма), Белобородый. Все они указывают на одну и ту же внешнюю примету, но различаются по способу образования: Белобородкин — через уменьшительно-ласкательное прозвище, что могло звучать более фамильярно или даже иронично. В современной России фамилия Белобородкина не входит в число частых, но сохранилась в тех же регионах — Архангельской, Кировской, Вологодской областях. Исторической путаницы с другими фамилиями нет, но в редких случаях её могли записать как Белобородкина вместо Белобородова из-за окающих говоров.