Фамилия Белугтна — редкий случай, когда написание говорит о происхождении больше, чем звучание. В ней нет ни одного из типичных русских фамильных суффиксов (-ов, -ин, -ский), а окончание -а выдает женскую форму. Перед нами не мужская фамилия в именительном падеже, а, скорее всего, женский вариант от фамилии Белугтн или Белугтен. Такая модель характерна для фамилий украинского, белорусского или, реже, польского происхождения, где женская линия фиксировалась отдельно (например, в метрических книгах женщину могли записать как «Белугтна» — жена Белугтна).

Основа фамилии — «белуг-» — с высокой вероятностью восходит к слову «белуга». Но не к рыбе напрямую, а к прозвищу Белуга. В русских говорах белугой могли назвать человека за крупное телосложение, белесый цвет волос или кожи, а также за громкий голос (белуга реветь). Второй корень — «-тн-» — выглядит инородно для славянских языков. Возможно, это результат искажения: фамилия могла звучать как Белугин, Белухтин или Белуткин, но при письменной фиксации (особенно в польской или еврейской канцелярии) буквы переставили или заменили. Например, сочетание «гт» вместо «кт» или «хт» — типичная описка или диалектное произношение.

Есть и другая версия: фамилия могла быть искусственно образована от топонима. В Литве и Беларуси есть несколько местечек с корнем «Белуг-» (например, Белугишки), а суффикс «-тн» мог быть добавлен по модели польских фамилий на -tnа (типа Загуртна, от «за гурой»). В таком случае Белугтна — это «та, что из Белуг», и фамилия указывает на место жительства.

Сословно носители такой фамилии, скорее всего, относились к крестьянам или мещанам западных губерний Российской империи (Виленской, Гродненской, Минской). Дворянские роды с подобным окончанием — редкость и обычно фиксируются в гербовниках с более прозрачной этимологией. Поскольку фамилия крайне редкая, её носители сегодня — это, вероятно, потомки одной или двух семей, разошедшихся по миру после войн и миграций XX века.