Фамилия Бенберя — редкий пример, где тюркская основа, украинское окончание и арабская модель имени сплелись воедино. Скорее всего, перед нами украинско-тюркская фамилия, которую стоит разбирать по частям, потому что каждая из них даёт свою версию происхождения.

Начнём с корня «бен». Здесь возможны два разных источника. Первый — турецкое слово ben, то есть «родинка». Если так, то прозвище Бенберя могли дать человеку с заметной родинкой на лице или руке. Второй источник — арабская приставка бен (или бин), которая означает «сын». В этом случае фамилия буквально переводится как «сын Беря», где Беря — личное имя или прозвище отца.

Теперь о второй части — «бер». У этого корня тоже несколько значений. В тюркских языках бер означает «один». Отсюда версия, что Бенберя — это «единственный сын» или «первенец». В турецком есть слово beri — «ближайший», что могло указывать на любимого или самого младшего ребёнка. Какую из версий выбрать? Арабская конструкция «сын такого-то» (бен + имя) — самая распространённая и логичная модель для фамилий, образованных от имён. Поэтому прозвище «сын Беря» выглядит правдоподобнее, чем «родинка» или «один», хотя и они не исключены.

Конечное «-я» — это чисто украинское влияние. В украинской ономастике фамилии нередко получали такое окончание, чтобы приспособить тюркскую основу к местному говору. Именно этот суффикс и выдаёт географию фамилии: её носители, скорее всего, жили на территории, где украинский и тюркский миры соприкасались — в южных степях, на Запорожье или в Крыму.

Итог простой: пращур рода Бенберя, по самой вероятной версии, был сыном человека по имени Беря, а его потомки, попав в украинскую языковую среду, закрепили фамилию с характерным окончанием. Другие толкования (через родинку или «единственного») остаются возможными, но менее доказанными.