Фамилия Беневоленкский — редкий вариант более известной фамилии Беневоленский, которая прочно связана с духовным сословием. В основе лежит латинское выражение bene volens, что значит «добровольно» или «по доброй воле». Так в семинариях могли называть юношей, пришедших учиться по собственному желанию, а не по принуждению родителей. В русском переводе эта фамилия звучит как Добровольский — и обе они были распространены среди священников.

Разница в написании — всего одна буква «к» перед суффиксом — не меняет корневого смысла, но указывает на другую словообразовательную модель. В фамилии Беневоленский можно увидеть суффикс -енск-, типичный для прилагательных от географических названий. Беневоленкский же, вероятно, образован через суффикс -к-, который в семинарской среде иногда прибавляли к уже готовой фамилии для придания ей более «простонародного» или уменьшительного оттенка. Впрочем, точное происхождение этого варианта остаётся предметом предположений: письменные источники по фамилии Беневоленкский крайне скудны, и серьёзных генеалогических исследований именно по этой ветви не проводилось.

Антон Чехов, хорошо знавший быт духовенства, в одном из писем заметил: «а Воскресенсков на Руси столько же, сколько в святцах Иванов и среди попов Беневоленских». Это подтверждает, что в XIX веке фамилия Беневоленский была настолько типичной для священников, что стала почти нарицательной. Её вариант с буквой «к» встречается гораздо реже и, скорее всего, возник в результате местного произношения или канцелярской ошибки при записи — подобные расхождения в одной букве нередко закреплялись за отдельными ветвями рода.

Таким образом, предки носителей фамилии Беневоленкский с высокой вероятностью были выходцами из духовного сословия, а сама фамилия — это семинарское «переводное» прозвище, указывающее на добровольный выбор пути.