Фамилия Бенгина — редкий пример, где суффикс -ин указывает не на принадлежность отцу (как в «Иванов сын»), а на женскую форму прозвища. В русской традиции фамилии на -ин массово образовывались от основ на -а/-я: Бенгин — от Бенга. Сама основа Бенг- почти наверняка не славянская, а тюркская или кавказская.

Вероятнее всего, прозвище Бенга восходит к тюркскому корню «бен» (я, сам) или к слову «бенг» — в некоторых тюркских языках так называли дурман, одурманивающее вещество. Прозвище могли дать человеку с необычным, «одурманенным» взглядом или поведением. Вторая версия — фамилия образована от мужского имени Бенги, которое в ряде тюркских языков означало «вечный» или «бессмертный». В таком случае Бенгин — буквально «сын Бенги».

Суффикс -ин не даёт сословной подсказки: в южных и восточных губерниях России, где оседали татары и народы Кавказа, крестьяне и мещане с такими фамилиями были обычным делом. Фамилия могла попасть в русский быт через браки, переселения или крещение в православие — тогда исходное имя или прозвище переделывали по русской модели.

Отдельная деталь: в записях XIX века фамилия встречается в двух написаниях — Бенгин и Бенгина, причём последняя форма чаще фиксировалась у женщин (вдов, дочерей) по старой традиции, когда жену или дочь Бенгина записывали как «Бенгина». В современном употреблении фамилия закрепилась за обоими полами в форме Бенгина, что делает её необычным примером сохранения женской модели как основной.