Фамилия Беняковкина — редкий случай, когда женская форма прочно закрепилась в документах, хотя исходная мужская (Беняковкин) встречается ещё реже. Чтобы разобраться в её происхождении, нужно отсечь суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Беняковкин, то есть сын или потомок Беняковки. Основа фамилии — Беняковка. Скорее всего, это не личное имя, а топоним: название деревни, села или хутора.

Вероятнее всего, предок носителя фамилии был выходцем из населённого пункта с названием Беняковка или Беняково. Такие названия встречаются в исторических областях расселения восточных славян — на территории современной Беларуси и западных регионов России. Корень «Беня» может восходить к уменьшительной форме канонического имени Вениамин (в просторечии Беня) или к диалектному прозвищу. Суффикс -овк- типичен для украинских и белорусских топонимов, образованных от личных имён (сравните: Ивановка, Петровка). Таким образом, Беняковка — это «поселение, основанное человеком по имени Беня».

Модель образования фамилии от названия места жительства через притяжательное прилагательное (Беняковка → Беняковкин) — не самая распространённая, но встречающаяся в крестьянской среде XIX века. Она указывает на то, что предки, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, переселившимися из конкретной деревни. Социальный статус — никакого дворянства, только сельское сословие. Географически фамилия тяготеет к юго-западным губерниям Российской империи (Могилёвская, Витебская, Черниговская), где подобные топонимы не редкость.

Другие версии — от прозвища Беняковка (например, по роду занятий или внешности) — менее убедительны, так как суффикс -овк- в прозвищах почти не встречается. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) эта фамилия не фиксируется, что подтверждает её локальный, очаговый характер. Если вы носите фамилию Беняковкина, ваши корни, вероятнее всего, ведут в небольшую деревню на западе бывшей Российской империи, откуда предки ушли в поисках лучшей доли, оставив название родного места в фамилии.