Фамилия Бетуганов — это не самостоятельное образование, а фонетический вариант фамилии Бейтуганов. Выпадение согласной «й» в данном случае — результат живых процессов в языке: при быстром произношении или в определенных диалектных условиях звук редуцировался, и написание закрепилось в документах. Такое явление встречается у многих фамилий тюркского происхождения, где исходная форма на «бей-» со временем упростилась до «бе-».

В основе обеих фамилий лежит составное прозвище или имя Бетуган (Бейтуган). Первая часть — «бей» — это кавказская огласовка тюркского титула «бек», который изначально был военным термином, а позже закрепился как обозначение князя, повелителя, господина. Вторая часть — «туган» — многозначна. В тюркских языках Кавказа и Средней Азии это слово означает «родственник, родной» и восходит к глаголу «родиться». Однако у тех же народов «туган» — это еще и «сокол». Такая двойная семантика нередка в тюркской ономастике: птица, особенно хищная, служила тотемным или почетным символом.

Скорее всего, прозвище Бейтуган давали знатному человеку, занимавшему высокое положение. Соединение титула «бей» с определением «родной» или «сокол» могло подчеркивать либо близость к правителю («родной князь»), либо его личные качества («князь-сокол»). Не исключено, что это было не прозвище, а личное имя с пожелательной семантикой: родители, называя сына Бетуганом, желали ему власти и богатства. В любом случае, потомка этого человека — Бетуганова — в русской традиции оформили стандартным патронимическим суффиксом -ов.

Фамилия Бетуганов редкая и имеет четкую географическую привязку к Северному Кавказу, в первую очередь к Кабардино-Балкарии и соседним регионам. Это закономерно: именно здесь тюркские (кумыкские, ногайские, карачаево-балкарские) антропонимы смешивались с местными кавказскими традициями именования, а русская административная машина фиксировала их в привычной для себя форме на -ов.