Фамилия Билкун — редкий случай, когда прозвище, скорее всего, перешло в фамилию почти без изменений, минуя типичные русские суффиксы -ов, -ин или -ский. Отсутствие суффикса указывает на то, что перед нами так называемая «фамилия-прозвище» в чистом виде, характерная для украинской, белорусской или южнорусской традиции, где фамилии нередко застывали в форме нарицательного слова.

Основа «билкун» — прозрачная и звучная. Она образована от глагола «бить» (или его диалектных вариантов) с помощью суффикса -ун, который в восточнославянских языках часто обозначал деятеля, склонного к действию: бегун, крикун, ворчун. Соответственно, Билкун — это тот, кто «бьёт». Но кого и зачем? Тут возможны два основных значения.

Первое и самое прямое — прозвище драчуна, забияки, человека с крутым нравом. Второе — профессиональное: на юге России и в Украине «билкуном» могли назвать работника, который выбивал (бил) масло из семян, мял лён или трепал шерсть. В словаре Даля зафиксировано слово «билко» — колотушка, било, так что связь с ремеслом вполне реальна. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным «билка» — вид травы или растение, но тогда прозвище звучало бы иначе.

Географически фамилия встречается точечно, преимущественно на западе и юге России, а также в восточных областях Украины. В дореволюционных переписях её носители — чаще крестьяне или мещане, без сословных привилегий. В среде духовенства или дворянства эта фамилия не фиксируется, что косвенно подтверждает её народное, прозвищное происхождение.

Интересно, что фамилия Билкун — редкий пример, когда прозвище не «облагородили» суффиксом. Это говорит о том, что в момент закрепления фамилии (в основном в XVIII–XIX веках) она уже воспринималась как родовое имя без дополнительной обработки. Сравните с однокоренными Билков, Билько, Бильченко — все они образованы от той же основы, но по-разному.