Фамилия Болкун — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию без каких-либо суффиксов, в чистом виде. Это так называемая «неоформленная» фамилия, характерная в основном для украинской и белорусской традиции, где прозвище на -ун (говорун, крикун, ворчун) легко становилось наследственным именем. В русской среде такие фамилии встречаются реже, чаще в южных регионах и на границе с Украиной.

Основа фамилии — глагол «болкать» или «болкнуть», который в диалектах (особенно смоленских, брянских, псковских) означал «болтать, говорить вздор, молоть чепуху», а также «стучать, греметь». Соответственно, Болкун — это прозвище болтливого человека, пустомели, или же, по второму значению, того, кто производит шум, грохот (например, возчик с плохо уложенным грузом). В некоторых говорах «болкун» — это ещё и «бубенчик, колокольчик», так что прозвище могли дать и по звенящей детали одежды или сбруи.

Словообразовательная модель проста и прозрачна: корень «болк-» (от общеславянского *bolk- со значением звукоподражания) плюс продуктивный суффиксальный элемент -ун, образующий имена деятеля по характерному действию. Сравните: говорун, ворчун, крикун. Морфологически фамилия мужского рода, склоняется как существительное второго склонения (Болкуна, Болкуну). Женский вариант — Болкун (несклоняемая), у детей — Болкун (для обоих полов) или традиционные Болкунов/Болкунова, если фамилия русифицировалась.

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и украинским землям. Встречается на Смоленщине, в Беларуси, на Черниговщине. В старых документах XVII–XVIII веков её можно найти среди казаков и крестьян, где прозвища давались метко и без затей. Социальный контекст: носитель фамилии — скорее всего, выходец из простонародья, человек с живым, возможно, излишне говорливым характером, которого в деревне прозвали за эту черту. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — она осталась в крестьянской и мещанской среде.

В написании возможны варианты: Болкун и Балкун (через «а» под влиянием аканья). Встречаются однокоренные фамилии Болкачёв, Болкотун, Болтунов — все они восходят к тому же звуковому образу болтовни и шума.