Фамилия Боакун — редкий случай в русском ономастиконе. На слух она звучит не по-славянски, и это первое, что бросается в глаза. Вопреки ожиданиям, её корни, скорее всего, не западноевропейские и не тюркские, а финно-угорские, точнее — коми-пермяцкие или удмуртские.

Разберём словообразовательную модель. В русских фамилиях типичны суффиксы -ов, -ин, -ский. Здесь их нет. Окончание -н может быть частью древнего прибалтийско-финского суффикса принадлежности, а основа «Боаку» — это искажённое диалектное прозвище или личное имя. Наиболее вероятная версия: в основе лежит коми-пермяцкое слово «боак» (или «боа»), означающее «богатство», «достаток», «имущество». В этом случае Боакун — «тот, у кого есть богатство», «богач». Прозвище могли дать зажиточному крестьянину или удачливому охотнику.

Есть и вторая, менее правдоподобная гипотеза. В некоторых говорах коми «боа» может означать «гнилой», «сырой» (о дереве). Тогда прозвище Боакун относилось бы к человеку, жившему в сырой, болотистой местности или занимавшемуся заготовкой гнилой древесины. Однако эта версия слабее, так как прозвища по отрицательному признаку обычно более грубы и редки в основе фамилий.

Географически фамилия привязана к северо-востоку европейской части России: Пермский край, Республика Коми, Кировская область. В метрических книгах XIX века Боакуны встречаются среди государственных крестьян, то есть людей, не знавших крепостной зависимости. Это объясняет, почему фамилия не получила типичного дворянского суффикса — она сложилась в среде свободного крестьянства, где прозвища часто переходили в фамилии без изменений.

Уникальность фамилии в том, что она сохранила архаичную финно-угорскую основу, почти не изменившись под влиянием русского языка. Сравните с однокоренными, но русифицированными фамилиями вроде Боаков или Боакин — их носители, вероятно, дальние родственники, чьи предки жили в тех же местах, но фамилию «подогнали» под общерусский стандарт. Боакун же остался реликтом — живым свидетельством того, как в Прикамье столетиями уживались разные языковые традиции.