Фамилия Блакун звучит не по-русски, и это первое, что бросается в глаза. В ней нет типичных славянских фамильных суффиксов -ов, -ин или -ский. Окончание -ун характерно для украинских, белорусских и польских фамилий, образованных от глаголов или прозвищ. В данном случае основа, скорее всего, связана с глаголом «блакати» или «блекотати» — в украинском и южнорусских говорах это означает «блеять», «кричать по-овечьи». Соответственно, Блакун — прозвище человека с громким, резким голосом или того, кто постоянно «тянет» одну ноту, как овца. Вторая, менее очевидная версия — связь с диалектным «блакитний» (голубой). В этом случае прозвище могли дать светлоглазому или голубоглазому человеку, а суффикс -ун указывает на носителя признака. Такая модель («цвет + -ун») встречается реже, но не исключена.

Географически фамилия Блакун тяготеет к западу Украины и, возможно, к юго-восточной Польше. В русских метрических книгах XIX века она почти не встречается, зато в реестрах казаков или крестьян Волынской, Подольской и Киевской губерний — вполне. Если предки были из этих мест, то Блакун — это не случайная ошибка писаря, а именно устоявшееся прозвище, которое закрепилось за родом. Социальный слой — чаще всего крестьяне или казаки, потому что дворянские фамилии в этой части империи обычно оформлялись через -ский.

Словообразовательная модель проста: корень «блак-» (от «блеять» или «блакитный») плюс суффикс деятеля -ун. В украинской ономастике таких фамилий много: Крикун, Скакун, Брехун. Блакун стоит в том же ряду — звучная, почти звукоподражательная фамилия, которая сразу даёт представление о характере или внешности первого носителя. Спор между версиями «голос» и «цвет» решается в пользу первой: она проще и типичнее для прозвищного именования.