Фамилия Биркун образована от аналогичного прозвища, которое восходит к украинскому слову «бирка» - «однолетняя овца». Согласно этому, такое прозвище мог получить человек, разводивший овец. Менее вероятно, что в основе прозвища Биркун лежит нарицательное «бирка» - «палочка или дощечка, на которой делали нарезки для счета, подсчетов в хозяйстве». В таком случае, Биркуном могли прозвать счетовода.