Фамилия Билоног — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка было двукоренным и описательным. Первая часть «било-» восходит к глаголу «бить», вторая — к слову «нога». Самый прямой смысл — «тот, кто бьёт ногой». В русских говорах «билоног» могли называть человека с сильным или резким ударом ноги, например, драчуна, который предпочитал драться ногами, или, напротив, лошадь, которая брыкается. В переносном значении так могли прозвать непоседливого, беспокойного человека — этакого «непоседу», которому всё время куда-то надо бежать и «бить ногой» от нетерпения.

Словообразовательная модель фамилии нестандартна. В русских фамилиях редко встречается основа, где глагольный корень соединён с объектом действия без суффикса. Обычно такие сложения дают фамилии на -ов: например, Бьющий + нога дало бы Билоногов. Но здесь — чистая основа, без патронимического суффикса. Это указывает на то, что фамилия закрепилась скорее в украинской или белорусской среде, где модель «глагол + существительное» в прозвищах встречается чаще (сравните: Вернигора, Непийвода). В украинском языке «билоног» звучит естественнее, чем в русском, где скорее сказали бы «бейнога» или «битоног».

Географически фамилия тяготеет к западным и юго-западным регионам бывшей Российской империи. Встречается в реестрах казаков и мещан Черниговской, Полтавской, Херсонской губерний. В XIX веке носители фамилии записывались чаще как крестьяне или однодворцы, реже — как казаки. Сословная принадлежность не была единой: прозвище могло закрепиться за любым человеком, которого в округе знали по манере ходить или драться.

Версия о связи фамилии с профессией (например, «билоног» — тот, кто бьёт ногами по глине или по снопам) менее убедительна. В ремёслах такое действие называли конкретнее: «глиномес», «молотильщик». Скорее всего, Билоног — это прозвище по поведению, а не по занятию. Споров вокруг этимологии почти нет: все источники сходятся на глагольной основе.