Фамилия Блаженкова — женская форма, образованная от мужской Блаженков. Её основа — прозвище или мирское имя Блаженко, которое в старину могли дать человеку с тихим, кротким нравом или, что не менее вероятно, юродивому. В древнерусской культуре слово «блаженный» имело двойной смысл: и «счастливый, благодатный», и «божевольный, чудаковатый». Так что прозвище могло относиться и к человеку, которого считали святым простецом, и к тому, кто был просто не от мира сего.

Суффикс -к- в основе Блаженко указывает на уменьшительно-ласкательную или обиходную форму, а -ов- в окончании фамилии — на типичную модель «чей?»: сын, внук или потомок Блаженка. Такие фамилии массово закрепились в центральных и северных губерниях России в XVII–XVIII веках, когда крестьян и посадских людей начали вносить в ревизские сказки с единой фамилией.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с церковным праздником Благовещения или с именем Блаженный, которое иногда давали при крещении в честь святого. Однако в святцах такого имени нет, поэтому версия с прозвищем выглядит убедительнее.

Встречаемость фамилии Блаженкова невысока. По данным переписей XIX–XX веков, она фиксировалась в основном в Вологодской, Костромской и Ярославской губерниях — районах, где говоры сохраняли слово «блаженный» в бытовом обиходе. В южных и сибирских регионах фамилия почти не встречается.

Словообразовательно фамилия стоит в одном ряду с Блаженновым, Блаженовым и Блажениновым, но отличается от них именно суффиксом -к-, который придаёт основе бытовой, «деревенский» оттенок. Если Блаженнов мог быть потомком человека с фамилией-характеристикой, то Блаженков — скорее потомок конкретного носителя прозвища Блаженко.