Фамилия Блынские — редкий пример того, как географическое прозвище могло изменить свою гласную, породив загадку для этимологов. Скорее всего, её основа — слово «блонье», которое в старорусских говорах означало низину, пойменный луг у реки или, в некоторых областях, предместье города. Тогда фамилия первоначально звучала как Блонские и указывала на человека, жившего на таком лугу или на окраине. Со временем «о» перешло в «ы» — возможно, под влиянием местного говора или ошибки писаря.

Есть и вторая версия: фамилия могла произойти напрямую от названия населённого пункта Блынск. Если такой хутор или деревня существовали, прозвище Блынский получал выходец оттуда — распространённая модель для фамилий на -ский.

Менее вероятно, но не исключено, что в основе лежит слово «блона» — диалектное название говядины, древесины или войлока. В этом случае прозвище могло относиться к роду занятий: торговец мясом, лесник или ремесленник по войлоку. Но эта версия слабее, так как связь с «блоньем» и географией встречается в фамилиях на -ский гораздо чаще.

Суффикс -ский в фамилии Блынские указывает на её происхождение из шляхетской или церковной среды, но в России такие фамилии нередко давали и крестьянам, переселившимся из другого места. Точно определить, когда и где фамилия появилась впервые, невозможно — письменные источники не сохранили ранних упоминаний.