Фамилия Бобокалонов — одна из тех, что не оставляют сомнений в своём восточном происхождении. Её основа восходит к таджикскому или узбекскому имени Бобокалон, где «бобо» означает «дед», «отец» или «почтенный старец», а «калон» переводится как «большой», «великий», «старший». Таким образом, имя Бобокалон можно истолковать как «великий старец» или «уважаемый предок». Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ов, который в этом случае присоединился к восточному имени, закрепив его как родовое прозвание.

Словообразовательная цепочка проста: личное имя Бобокалон → притяжательное прилагательное Бобокалонов («сын Бобокалона»). Это типичный пример того, как в XIX–XX веках фиксировались фамилии у народов Средней Азии, входивших в состав Российской империи. При переписях и паспортизации русские чиновники часто добавляли окончание -ов к местным именам, превращая их в фамилии по образцу русских отчеств.

Вероятно, первый носитель имени Бобокалон был человеком, пользовавшимся особым уважением в своей общине — аксакалом, религиозным наставником или просто старшим в роду. Встречается эта фамилия в основном в Узбекистане, Таджикистане и среди выходцев из этих регионов в России. Варианты написания — Бобокаланов — встречаются реже и связаны с особенностями записи на слух.

В отличие от фамилий, образованных от профессий или прозвищ, Бобокалонов несёт в себе не характеристику человека, а прямое указание на его почётное имя-титул. Сравните с однокоренными Бобоев, Бобокулов, Бобомуродов — все они отсылают к корню «бобо», но каждый имеет свой оттенок значения. В случае Бобокалонова акцент сделан на величии и старшинстве, что делает эту фамилию своего рода родовым памятником статусу предка.