Фамилия Бокоев — один из характерных примеров осетинских родовых имен, закрепившихся в русской официальной письменности. В осетинской среде она звучит как Бокотæ, что указывает на её исконное происхождение из этого региона. В основе фамилии лежит прозвище Боко, которое, скорее всего, связано с осетинским словом «бокъ» — «согнутый», «съежившийся», «сгорбленный».

Такое прозвище могло закрепиться за человеком с характерной внешностью — например, за сутулым или низко кланяющимся. В традиционных обществах прозвища по физическим особенностям были обычной практикой: они не несли оскорбительного оттенка, а служили точным бытовым маркером, по которому человека узнавали в общине. Потомки Боко, постепенно утратив прямое значение прозвища, стали писаться Бокоевыми.

Фамилия образована по стандартной для русского языка патронимической модели: к основе Боко- добавлен суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Боко). Это типичный случай, когда осетинское родовое имя (фамилия на -тæ) адаптировалось под русскую грамматику при записи в метрические книги и ревизские сказки.

В отличие от многих русских фамилий, которые восходят к крестильным именам или названиям профессий, Бокоевы прямо связаны с кавказским языковым и культурным пластом. Осетинский язык, сохранивший элементы скифо-сарматского наследия, придаёт этой фамилии дополнительный исторический колорит. Слово «бокъ» в осетинском имеет параллели в других иранских языках, что делает фамилию Бокоев не просто бытовым прозвищем, а возможным отражением древних языковых связей.