Фамилия Бокоева (в осетинском написании — Бокотæ) образована по типичной для осетинского и многих кавказских языков модели: к основе прозвища Боко добавился русский суффикс -ев, указывающий на принадлежность. В осетинской среде фамилия оформилась через суффикс -тæ, обозначающий род или потомков (Бокотæ — «принадлежащие Боко»). Собственно, именно осетинский вариант Бокотæ и даёт ключ к пониманию корня.

Прозвище Боко, скорее всего, восходит к осетинскому слову «бокъ» — «согнутый», «съежившийся», «сгорбленный». Исходное слово звучит с твёрдым гортанным звуком, который в русской передаче исчез, оставив простое «боко». Смысл прозвища — внешняя примета: Боком называли сутулого, сгорбленного человека. В среде, где физическая стать и осанка имели значение, такая характеристика легко прикреплялась к человеку и передавалась потомкам.

Фамилия Бокоева — осетинская по происхождению, но её русское окончание -ев указывает на то, что фиксация фамилии в документах (например, при записи в метрические книги или ревизские сказки) происходила уже через русскую канцелярию. Это типичная ситуация для народов Кавказа, чьи фамилии оформлялись по общероссийским стандартам в XIX веке.

Бокоевых можно встретить в Северной и Южной Осетии, а также среди осетинской диаспоры. Точное время возникновения рода назвать сложно: прозвищные фамилии такого типа складывались веками, и для серьёзных генеалогических выводов нужны архивные изыскания. Но сама модель — прозвище по внешности плюс суффикс рода — ставит фамилию в один ряд с другими осетинскими фамилиями, образованными от физических качеств предка.