Фамилия Бокшенян звучит как типичная армянская фамилия, и это первое, что бросается в глаза. Формант -ян (в дореволюционном написании -янц) указывает на принадлежность к роду или происхождение из определённого места. В армянском языке суффикс -ян означает «из рода такого-то» или «сын такого-то». Бокшенян, скорее всего, означает «из рода Бокшена» или «потомок Бокшена».

Основа фамилии — Бокшен — не имеет прямого и очевидного значения в современном армянском языке. Это может быть либо диалектное слово, либо искажённое имя, либо топоним. Например, в армянских диалектах встречаются корни, связанные с «бок» (боковая часть, удар) или «бох» (крик, шум), но это лишь предположения. Более вероятно, что Бокшен — это вариант личного имени или прозвища, которое со временем утратило прозрачную семантику.

География фамилии также подсказывает возможное происхождение. Бокшеняны встречаются среди армян, переселившихся из Западной Армении (исторические области, ныне на территории Турции) или из Нагорного Карабаха. В Западной Армении существовали селения с похожими названиями, например, Бокшен или Бокшеник, которые могли дать фамилию переселенцам. Если предки носили прозвище по месту жительства, то Бокшенян — это «выходец из Бокшена».

С точки зрения социального контекста, армянские фамилии на -ян в массе своей не указывают на дворянское происхождение. Они были распространены среди крестьян, ремесленников и духовенства. Бокшеняны, скорее всего, были простыми людьми — земледельцами или ремесленниками, получившими фамилию по родовому прозвищу или по названию родного села.

В русском языке фамилия склоняется по правилам для армянских фамилий на -ян: в мужском роде — Бокшенян, Бокшеняна, Бокшеняну и так далее; в женском — не склоняется. На письме встречаются варианты Бокшенян и Бокшенянц — второй более архаичный, но в современном обиходе почти не используется.

Таким образом, Бокшенян — это армянская фамилия, образованная по стандартной модели с суффиксом -ян, указывающая на происхождение от человека с прозвищем Бокшен или из местности с таким названием. Точное значение основы сегодня восстановить сложно, но это не редкость для фамилий, уходящих корнями в глубь веков.