Фамилия Болганова принадлежит к распространённому типу русских фамилий, образованных с помощью суффикса -ов от мужского имени или прозвища. В основе лежит мужская форма Болган, которая, скорее всего, восходит к тюркскому слову «булган» — «мутный, взбаламученный» или «смутьян, бунтарь». В тюркских языках это слово имеет оттенок беспокойства, хаоса, непослушания. В русских говорах, особенно в южных и сибирских областях, где было сильное тюркское влияние, такое прозвище могли дать человеку неспокойного, вздорного нрава, любителю споров и переполоха.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с географическим названием. В Поволжье и Приуралье встречаются топонимы Болганово или Болган, происходящие от того же тюркского корня. В этом случае предок носителя фамилии мог получить прозвище по месту жительства — выходец из Болганова. Однако для фамилий на -ов, образованных от названий сел, чаще используется суффикс -ский (Болгановский), поэтому версия с прозвищем выглядит предпочтительнее.

Словообразовательная модель проста: прозвище Болган + патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («сын Болгана»). Окончание -а — женский вариант, то есть Болганова — это дочь или жена Болганова. По сословному составу фамилия преимущественно крестьянская, распространена среди русских, а также у народов Поволжья (татар, башкир, чувашей), где тюркские корни органично вплелись в местную ономастику.

В документах фамилия встречается с XVII–XVIII веков, преимущественно в записях по Казанской, Симбирской и Оренбургской губерниям. Интересно, что в некоторых диалектах слово «болган» могло означать и «болтун, пустомеля» — дополнительный оттенок, который не противоречит основной версии. Таким образом, Болгановы — потомки человека, которого в округе знали как неугомонного, шумного или просто неспокойного.