Фамилия Болохин — одна из тех, что ставят этимолога перед выбором: какой из двух корней считать основным? Внешне она похожа на множество русских фамилий на -ин, образованных от личного имени или прозвища на -а/-я. Но проблема в том, что имя или прозвище «Болоха» в старых документах встречается редко, и его значение не лежит на поверхности.

Самая прямая и правдоподобная версия связывает фамилию с диалектным словом «болоха» — так в ряде южнорусских и западных говоров называли блоху. Прозвище Блоха (а фамилии Блохин, Блохины — одни из самых распространённых) давали юркому, мелкому, вертлявому человеку или, наоборот, в качестве охранительного имени, чтобы злые силы не позарились на «мелкую» добычу. Фонетический переход «блоха» → «болоха» — результат аканья и полногласия, типичного для некоторых говоров. Таким образом, Болохин — это диалектный вариант фамилии Блохин, закрепившийся на письме. В пользу этой версии говорит и то, что в ономастических справочниках фамилии Болохов, Болохин часто соседствуют с Блохиными, указывая на одну и ту же основу.

Вторая версия выводит фамилию от прозвища «Болох», которое могло быть связано с глаголом «болокать» (говорить невнятно, бормотать) или с устаревшим «болох» в значении «болтун, пустомеля». Однако эта гипотеза слабее: глагольные прозвища на -ох (типа «болохать») в русской антропонимии встречаются реже, чем зооморфные, и не имеют такого массового подтверждения, как «блоха».

Географически фамилия Болохин тяготеет к регионам, где было распространено акающее произношение: к югу от Москвы, в Тульской, Рязанской, Калужской, Орловской областях. Встречается она нечасто, но стабильно, что подтверждает её местное, диалектное происхождение. По социальному составу носители фамилии, скорее всего, были из крестьянской или посадской среды — прозвища от насекомых и бытовых черт характера были там обычным делом.

Таким образом, Болохин — это не редкая загадка, а скорее «фонетический родственник» известной фамилии Блохин, сохранивший живое народное произношение в своей письменной форме.