Фамилия Болоховская — типичный пример «географической» фамилии, которая указывает на происхождение человека из определенной местности. В основе лежит название исторической области Болоховская Земля. Это древнерусское образование XII–XIII веков, которое располагалось в верховьях Южного Буга и в бассейне рек Горынь, Случь и Тетерев. Сейчас эти земли входят в состав Хмельницкой области Украины.

В те времена Болоховская Земля была особым регионом: она отделилась от Киевского княжества, признала власть монголо-татар, а позже вошла в состав Галицко-Волынского княжества. Жителей этой области называли «болоховцами» или «болоховскими». Когда человек переселялся в другой город или княжество, его могли записать как «Болоховский» — по месту, откуда он пришел.

Фамилия образована по продуктивной модели с суффиксом -ск-, который в русских и украинских фамилиях чаще всего указывает на связь с географическим объектом (сравните: Тверской, Рязанский, Можайский). Окончание -ая — это форма женского рода, типичная для фамилий, которые склоняются как прилагательные. В мужском варианте фамилия звучала бы как Болоховский.

Само название «Болоховская Земля» не имеет прямого отношения к слову «болото», хотя такое объяснение напрашивается. По одной из версий, в основе лежит тюркское или древнерусское слово, связанное с местным ландшафтом, но точная этимология до сих пор остается предметом споров среди историков.

С социальной точки зрения, носители этой фамилии — потомки выходцев из Болоховской Земли. Скорее всего, предки были либо мелкими землевладельцами, либо крестьянами, переселившимися в другие регионы Русского государства или Речи Посполитой. Фамилия встречается в исторических документах на территориях Украины, Беларуси и юга России, что подтверждает миграционный характер ее происхождения.