Фамилия Болонкина — женская форма фамилии Болонкин, которая образовалась от прозвища Болонка. У этого прозвища есть несколько возможных источников, и все они по-своему интересны. Самая распространённая версия связывает прозвище Болонка с названием маленькой, пушистой собачки — болонки. В этом случае прозвище мог получить человек, у которого жила такая собака, либо тот, кто внешне напоминал её: был невысок ростом, имел длинные волосы или звонкий, тонкий голос.

Однако есть и другие, менее очевидные трактовки. В основе прозвища могло лежать слово «болона» — в старину так называли оболочку, наволоку, перепонку, то есть всё, что одевает или облегает. В этом смысле Болонкой могли прозвать человека, носившего плотную, длинную одежду. Слово «болона» имело и другие значения: «опухоль», «голова палицы». Исходя из этого, прозвище могло указывать на замкнутого, необщительного человека, любящего уединение, либо на больного, либо на того, кто изготавливал палицы.

В псковских, смоленских и курских говорах существовало слово «болонка» — так называли приставной зимний ставень для тепла, иногда обитый войлоком, или щит, заслон. В таком случае прозвище Болонка относилось к «профессиональным» именованиям и указывало на род занятий человека — возможно, он делал такие ставни или занимался утеплением домов. Фамилия Болонкина, как и многие другие русские фамилии, закрепилась за потомками того, кого в народе прозвали Болонкой, и передавалась из поколения в поколение.

Фамилия Болонкины встречается в исторических документах. В Книге памяти Московской области упоминается Александр Александрович Болонкин (род. 1933, Москва) — математик, известный своими разработками в области космонавтики. Он предложил теорию кабельного запуска космических кораблей и спутников, гиперзвуковой космический пускатель, кинетический антигравитатор, многоотражательные двигатели, кинетические космические башни, электростатический парус, прямоточные космические двигатели, тросовую авиацию и многое другое.